Des propriétés, parfois des hameaux entiers, ne peuvent pas être connectés avec le réseau tout à l'égout, généralement parce qu'ils sont trop éloignés ou qu'il est trop coûteux ou trop difficile de les connecter ou créer un nouvelle station d'épuration pour seulement quelques maisons. Dans ce cas, afin de ne pas vider eaux usées non traitées dans le milieu naturel, ces maisons doivent être équipés d'un système individuel de traitement des eaux usées (appelé "station d'assainnisement autonome" ou "assainissement non collectif"), mieux connu sous le grand public sous le nom de "fosse septique".

Une micro station d’épuration est une solution d'assainissement individuel de traitement des eaux usées domestiques. Elle fonctionnent selon le même principe qu'une station d’épuration urbaine, grâce à un procédé dit « à boue activée » ou à culture fixée.

Les fosses septiques ont pour origine juste de récuperer les eaux usées provenant des toilettes de la maison et les eaux usées provenant des éviers, des douches, etc. Aujourd'hui, la norme pour un système de fosse septique permet d'éviter trop de produits chimiques qui vont directement dans la nappe phréatique.

Aujourd'hui en vertu des règles européennes, nous pouvons installer des micro stations d'épuration qui sont des mini stations d'épuration des eaux usées destinées à faire face à des maisons individuelles en France. Ces plantes traitent des eaux usées peut être considéré comme le "standard" de traitement des eaux usées à domicile